A mangát Yoshida Reiko írta és Ikumi Mia rajzolta. A Kódansa kiadó Nakayoshi című soujomagazinjában jelent meg folytatásban, 2000 szeptemberétől 2003 februárjáig. Később kiadták tankóbon formában is, amely hét kötetből állt. Ezután következett a Tokyo Mew Mew à la Mode széria, egy kétkötetes folytatása a Tokyo Mew Mew-nak, ami 2003 áprilisától 2004 februárjáig szintén a Nakayoshi Magazinban volt olvasható először. Reiko ezt már nem segített megírni. A manga angol fordítását Észak-Amerikában a TOKYOPOP adta ki, Szingapúrban pedig a Chuang Yi kiadó, szintén angolul.[1] A Tokyo Mew Mew à la Mode mellett vannak olyan rövid bónusztörténetek, amik csak a mangakötetekben találhatóak meg. De a történetet megelőző Tokyo Kuro Neko Musume (Tokyo Black Cat Girl) című történet – ami valószínűleg a manga ötletét adta – is csak mangaformában jelent meg.